A quinta temporada se passa 18 meses após a quarta, e começa às 7h, em Los Angeles. Todos pensam que Bauer está morto, com exceção de seus amigos próximos, mas ele é forçado a revelar a verdade quando alguns de seus amigos são mortos. Enquanto isso, terroristas com contatos no governo dos Estados Unidos tentam roubar um gás tóxico para proteger os interesses dos norte-americanos no petróleo da Ásia. Bauer descobre a conspiração e consegue impedi-la.